Спосіб контролю денатурації ДНК при використанні електрофорезу у поліакриламідному гелі застосовується шляхом проведення електрофоретичного розподілу у денатуруючому поліакриламідному гелі ампліфікованих мікросателітних локусів, який відрізняється тим, що додатково до дослідних проб у кожному гелі використовують контрольний зразок, який містить ампліфікований цільовий фрагмент ядерної ДНК гомозиготної особини виду Gallus gallus, що містить у своєму складі динутлеотидний мотив (мікросателіт), після проведення електрофорезу у випадку досягнення повної (ефективної) денатурації дослідних проб у контрольному зразку в наявності лише один фрагмент ДНК, наявність більшої кількості фрагментів ДНК вказує на неповне досягнення умов денатурації та, відповідно, на необхідність повторення процедури електрофоретичного розподілу дослідних проб.